WARNING:
JavaScript is turned OFF. None of the links on this concept map will
work until it is reactivated.
If you need help turning JavaScript On, click here.
This Concept Map, created with IHMC CmapTools, has information related to: harmtausta.cmap, Havaintoja, ideoita, ongelmia Aminohapot-- ikosahedronin kolmiot Ikosahedronilla 20 kolmiota tah- koina. Amino-happoja 20. ! Aminohapot vastaavat harmonian kolmisointuja. ! DNA nuotit- proteiinit musiikki ? Samaa aminohappoa koodaa usei- ta DNA kodoneja. Mitä lisäinformaa- tio vastaa? Onko se realisoitunut tunut aminohapon magneettisella keholla? ?! Vastaavatko luvut (n0,n1,n2) amino-hapon kemiallisia omi- naisuuksia? Kolmen tyyppisiä aminohappoja: 3 emäspolaarista 10 ei-polaarista 7 ja polaarista tai hapan-polaarista. Luvut toteuttavat ehdot: Määritteleekö bioharmonian n=(3,7,10)? Havainto: Tämä ikosahedrinen sykli ei ole mahdollinen! (4,8,8) sykli löytyy. Löytyi käsipelillä! ! Mukaan myös 21s ja 22s amino- happo: Pyl ja Sec ja lisää kolmioita. Tetra-ikosahedroni liimaamalla ikosahedroniin tetrahedroni. Idea syklistä (4,8,8) bioharmoniana ei kuitenkaan todennäköisesti oikea kuten selvisi vasta muutama viikko sitten., Havaintoja, ideoita, ongelmia Aminohapot-- ikosahedronin kolmiot Ikosahedronilla 20 kolmiota tah- koina. Amino-happoja 20. ! Aminohapot vastaavat harmonian kolmisointuja. ! DNA nuotit- proteiinit musiikki ? Samaa aminohappoa koodaa usei- ta DNA kodoneja. Mitä lisäinformaa- tio vastaa? Onko se realisoitunut tunut aminohapon magneettisella keholla? ?! Vastaavatko luvut (n0,n1,n2) amino-hapon kemiallisia omi- naisuuksia? Kolmen tyyppisiä aminohappoja: 3 emäspolaarista 10 ei-polaarista 7 ja polaarista tai hapan-polaarista. Luvut toteuttavat ehdot: Määritteleekö bioharmonian n=(3,7,10)? Havainto: Tämä ikosahedrinen sykli ei ole mahdollinen! (4,8,8) sykli löytyy. Löytyi käsipelillä! ! Mukaan myös 21s ja 22s amino- happo: Pyl ja Sec ja lisää kolmioita. Tetra-ikosahedroni liimaamalla ikosahedroniin tetrahedroni. Idea syklistä (4,8,8) bioharmoniana ei kuitenkaan todennäköisesti oikea kuten selvisi vasta muutama viikko sitten., Havaintoja, ideoita, ongelmia Fuusio tetra- hedronisesta ja ikoshedronisesta koodista <math xmlns="http://www.w3.org/1998/Math/MathML"> <mrow> <mtext> ! Tetrahedroninen koodi. 4 kodonia ja neljä amino- happoa. (Kombinatorinen hierarkia koodeille ennustaa 2-koo- din, 4-koodin, tutun 64-koo- din ja 2^(126) -koodin ("memeettinen" koodi. jolle 21 DNA kodonin sarjat esittäisivät kodonit).) ! Koodien fuusio: ikosa- hedroni ja tetrahedroni fuusioituvat tetraikosa- hedroniksi pitkin yhteis- tä kolmiota joka punct. !Z1 ainoa tetrakoodin ainoa mahdollinen sym- metriaryhmä. 4 kodonia ja 4 amino-happoa: punct, ile, met, trp. ! Fuusiota ei aina tapahdu mRNA tasolla! Kolmio, joka ei enää yhteinen vas- taisikin Pyl tetrahedronille ja Sec ikosahedronille(tai päinvastoin). Stop koodaisi nyt Pyl ja Sec kuten on ha- vaittu! Saadaan sekä standardi geneettinen koodi että 21s ja 22s aminohappo! Ymmärretään koodin sym- metriarikko! </mtext> </mrow> </math>, Havaintoja, ideoita, ongelmia Katakarak- terisointi harmonialle Harmonian karkea ka- rakterisointi. a) Lukumäärä syklin sivuja kolmiossa luon- nehtii sointua. n=(n0, n1,n2). 0, 1 tai 2 kvinttiä. n0+n1+n2=20. Lisäksi toinen ehto n1+2*n2=2*12=24. b) Myös lukumäärät eri tyyppisille sointu- naapuruksille tärkei- tä: siis kolmiopareille, jotka "seinä-naapu- reita": (1,1), (1,2), (2,2) ovat mahdol- liset parit. c) Muitakin kriteerejä., Havaintoja, ideoita, ongelmia Geneettinen koodi ikosa- hedronin symmetrioista? Taustaa: annettua amino-happoa koodaa joukko kodoneja. Näiden lukumäärät kar- kein karakterisointi koodille. Havainto: Ikosahedronin symmetria- ryhmä sisältää aliryhminään Z6,Z4,Z2. Näiden ryhmien radoilla 6 tai 2, 4 ,2 kolmiota. a) Z6: 3 kpl 6n kolmion rataa:leu, ser, arg ja 1 2:n alkion rata. Ile jota koodaa yksi 4:stä jäljellä olevasta DNAsta? 3*6+1*2=20! b) Z4:5 kpl 4n kolmion rataa. 4*5=20! c) Z2: 10 2n kolmion rataa. phe, tyr, his,gln, asn, lys, asp,glu,cys, punct jota koodaa vie- lä 1 4:stä kodonista. 10*2=20! 60=20+20+20 jako näyttää pätevän. 60 kodonia jakautuvat kolmeen luokkaan, jotka vastaavat symmetria- ryhmiä Z6, Z4,Z2 ! !!60 kodonia jakaantuvat 20:n kodonin ryhmiin jotka vastaavat ikosahedronin kolmioita jotka muodostavat Zn:n radan! Ongelmat: ?4 DNAta 64:sta kodonista puuttuu: mistä ne saataisiin? ?ile ja punct: molempia tarvitaan koodaamaan lisäkodoni. ?Aminohappojakin puuttuu! trp ja met, joita koodaa 1 kodoni puuttuvat myös. ? Missä ovat 21s ja 22s aminohappo Sec ja Pyl?!, Havaintoja, ideoita, ongelmia Harmoniakäsitteen geometrisointi 12-sävel skaalassa 12 säveltä. Ikosahedronilla 12 verteksiä. !12-sävel-skaala esitet- tävissä Hamiltonin syk- linä ikosahedronilla. !Kvinttikerto. Peräkkäiset sävelet vastaavat naapuriverteksejä ikosa- hedronilla. !Kolmisoinnut vastaavat ikosahedronin kolmioita. Jokainen Hamiltonin sykli määrittelee sallitut kolmisoinnut ja harmo- niakäsityksen., Havaintoja, ideoita, ongelmia Harmoniakäsitteen geometrisointi 12-sävel skaalassa 12 säveltä. Ikosahedronilla 12 verteksiä. !12-sävel-skaala esitet- tävissä Hamiltonin syk- linä ikosahedronilla. !Kvinttikerto. Peräkkäiset sävelet vastaavat naapuriverteksejä ikosa- hedronilla. !Kolmisoinnut vastaavat ikosahedronin kolmioita. Jokainen Hamiltonin sykli määrittelee sallitut kolmisoinnut ja harmo- niakäsityksen.
